在無(wú)菌車間中，使空間內(nèi)達(dá)到無(wú)菌要求，就是室內(nèi)環(huán)境控制的重點(diǎn)?？刂莆⑸锏纳L(zhǎng)、殺滅或去除微生物的方法通常有兩種，一種為化學(xué)類，另一種為物理類。其中，化學(xué)方法有化學(xué)劑、氣化雙氧水、臭氧和環(huán)氧乙烷等;物理方法有濕熱或干熱、輻射和過(guò)濾等。

無(wú)塵無(wú)菌車間是指將一定空間范圍內(nèi)之空氣中的微粒子、有害空氣、等之污染物排除，并將室內(nèi)之溫度、潔凈度、室內(nèi)壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動(dòng)及照明、靜電控制在某一需求范圍內(nèi)，而所給予特別設(shè)計(jì)之房間。

無(wú)塵無(wú)菌車間內(nèi)空氣的流動(dòng)有兩種情況：一種是層流的(即室內(nèi)一切懸浮粒子都保持在層流層中運(yùn)動(dòng));另一種是非層流的(即室內(nèi)空氣的流動(dòng)是紊流的)。裝有一般空調(diào)系統(tǒng)的潔凈室，室內(nèi)空氣的流動(dòng)屬于非層流(紊流)，既可使空氣中夾帶的混懸粒子迅速混合，也可使室內(nèi)靜止的微粒重新飛揚(yáng)，部分空氣還可出現(xiàn)停滯狀態(tài)。

在獲得了無(wú)菌環(huán)境和無(wú)菌材料后，還要保持無(wú)菌狀態(tài)，才能對(duì)某種特定的已知微生物進(jìn)行研究或利用它們的功能，否則外界的各種微生物很容易混入。外界不相干的微生物混入的現(xiàn)象，在微生物學(xué)中叫做污染雜菌。防止污染是微生物學(xué)工作中十分關(guān)鍵的技術(shù)。