北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準的國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準的國家臨床重點?？?，中醫(yī)眼科學為國家中醫(yī)藥管理局批準的中醫(yī)重點學科。首都醫(yī)科大學北京眼科學院和耳鼻咽喉科學院設在院內(nèi)。醫(yī)院設有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

改革開放以來，醫(yī)院共獲得省部級以上科技成果獎勵138項，其中8項，獲得國家自然科學基金資助項目253項。

同仁醫(yī)院歷經(jīng)百余年發(fā)展，凝練出“精誠勤和”的醫(yī)院精神。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發(fā)揚百年同仁優(yōu)良傳統(tǒng)，弘揚主流文化，苦練內(nèi)功，精于內(nèi)涵，團結(jié)一致，創(chuàng)新發(fā)展，努力為人民群眾提供優(yōu)質(zhì)、、快捷的醫(yī)療服務。

對于一些特殊性的科室（性病、特殊病等），可以做完全保密，完成門診預約，做人性化服務和信息化的科學結(jié)合。用戶如果通過電話掛號之后，當日并沒有趕到醫(yī)院，則過期自動退號，掛號費自動退回用戶賬號。

患者就醫(yī)時，須持本人有效身份證件（包括二代居民身份證、戶口簿、社會保障卡、護照、軍官證等）進行掛號就診，同時提供本人手機號碼等有效聯(lián)系方式；對未攜帶有效身份證件的患者，醫(yī)療機構(gòu)須登記其姓名、身份證號、聯(lián)系方式、家庭住址等信息，對急診和危重患者，醫(yī)療機構(gòu)應先行診療救治，待病情穩(wěn)定后，再核實其身份信息。