在醫(yī)療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫(yī)學教育，任美國內科醫(yī)師學會（ACP）Fellow、美國醫(yī)學研究所（IOM）中國醫(yī)學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫(yī)師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協(xié)和醫(yī)學院教學名師等榮譽，帶領普通內科獲得2015年北京協(xié)和醫(yī)學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區(qū)健康促進首 席專家。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科從建科時僅有3張病床的小科室發(fā)展到今天，協(xié)和風濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬人次，不僅注重系統(tǒng)性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕關節(jié)炎、強直性脊柱炎等常見風濕性疾病的規(guī)范診治，更強調對少見風濕性疾病、風濕性疾病重要臟器損害以及風濕性疾病嚴重并發(fā)癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細致的評估、更有效的治 療效果。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科的患者90%以上來自外地，患者大多面臨疾病折磨和輾轉求診的雙重困難。為此，科里的醫(yī)生們連續(xù)多年保持的門診量，以滿足廣大風濕病患者的迫切就醫(yī)需求。

2020年8月，北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統(tǒng)手工、批量操作、定性檢測的酶聯(lián)免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發(fā)光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內三甲醫(yī)院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。