曾學(xué)軍教授在多項(xiàng)首發(fā)基金連續(xù)十年支持下開展大型綜合醫(yī)院與社區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)合作模式的研究。2005年始主持《社區(qū)中老年人健康管理規(guī)范》的制訂和推廣，成為國(guó)家公共衛(wèi)生規(guī)范項(xiàng)目之一，并于2015年成為國(guó)家推薦標(biāo)準(zhǔn)。

曾學(xué)軍教授參與了國(guó)內(nèi)目前所有關(guān)于痛風(fēng)和高尿酸血癥指南的制定工作， 2013 年?duì)款^制定了《高尿酸血癥社區(qū)管理規(guī)范草案》，2018年11月在中華全科醫(yī)師雜志上發(fā)表修訂版《高尿酸血癥社區(qū)管理流程的專家建議》，2020年4月再次牽頭制定《痛風(fēng)及高尿酸血癥基層診療指南》。

北京協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科為了促進(jìn)中國(guó)風(fēng)濕病的普及與提高，自建科以來，堅(jiān)持每年舉辦形式多樣的風(fēng)濕病學(xué)講習(xí)班和學(xué)術(shù)會(huì)議，編著多部風(fēng)濕病學(xué)專著，同時(shí)結(jié)合風(fēng)濕病學(xué)臨床的需要開展科學(xué)研究，取得了極大的成績(jī)，是國(guó)家教委風(fēng)濕病學(xué)博士學(xué)位授予點(diǎn)、風(fēng)濕免疫內(nèi)科博士后流動(dòng)站、國(guó)家教委風(fēng)濕病學(xué)重點(diǎn)學(xué)科單位、衛(wèi)生部住院醫(yī)師培訓(xùn)基地、風(fēng)濕免疫科?？评^續(xù)教育基地、風(fēng)濕臨床試驗(yàn)基地、教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，風(fēng)濕病學(xué)博士生/博士后培養(yǎng)單位，為全國(guó)培養(yǎng)了大量風(fēng)濕病學(xué)的專業(yè)人才。

重視科研是協(xié)和風(fēng)濕免疫科的傳統(tǒng)?？剖?979年起就率先在全國(guó)進(jìn)行自身抗體檢測(cè)的研究。1988年，“抗核抗體譜的建立及臨床應(yīng)用研究”獲國(guó)家科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)；1995年，“原發(fā)性干燥綜合征的系列研究”獲國(guó)家科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)；近年來，獲北京市科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)、華夏醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)等省部級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)共計(jì)13項(xiàng)。