1、 有些代理記賬公司沒有與委托單位簽訂正式的委托代理合同，對雙方的權利、義務缺少明確的規(guī)定，在實際工作中遇到異議時，往往無法分清責任。因此在選擇代賬公司的時候，企業(yè)就要更加謹慎。

2、個別 “代理記賬公司”沒有代理記賬資質（市財政局批準的代理記賬許可證、會計上崗證等），發(fā)生問題可以回避責任，損害委托單位的利益。這也是小企業(yè)在選擇代賬服務公司時必須要注意的事項。

3、 財務軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準的財務軟件來替代手工記賬。

4、 會計資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現(xiàn)遺失或毀損時無法查找。

5、代理記賬單位通常是定期或定時上門服務，日常業(yè)務可通過電話溝通，會計不是隨時在單位辦理和咨詢業(yè)務

委托代理記賬的委托人應當履行下列義務：

（1）對本單位發(fā)生的經(jīng)濟業(yè)務事項，應當填制或者取得符合國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定的原始憑證；

（2）應當配備專人負責日常貨幣收支和保管；

（3）及時向代理記賬機構提供真實、完整的原始憑證和其他相關資料；

（4）對于代理記賬機構退回的要求按照國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定進行更正、補充的原始憑證，應當及時予以更正、補充。

企業(yè)做賬流程

1.根據(jù)原始憑證編制記賬憑證

2.根據(jù)記賬憑證編制科目匯總表

3.根據(jù)記賬憑證和科目匯總表登記會計賬簿(包括總賬和明細賬)

4.根據(jù)會計賬簿(主要是總賬)編制會計報表(包括資產(chǎn)負債表和損益表)

5.根據(jù)會計報表編制納稅申報表

6.年終結轉損益(也可以逐月結轉損益)

7.編制年度會計報表(包括資產(chǎn)負債表，損益表，現(xiàn)金流量表)

8.根據(jù)年度會計報表編制所得稅年報和其他各稅種的匯算清繳自查表

費用類發(fā)票處理 做好內部單據(jù)報銷制度，規(guī)定報銷時間，及時收集公司員工手中的費用，單據(jù)，將其歸類入賬。認真查看費用單據(jù)是否合法，未取得合法憑據(jù)的費用是無法得到稅務機關的認可的。平時還應做好費用入賬金額控制，對類似招待費、廣告費等存在抵扣限額規(guī)定的費用科目，應及時核對發(fā)生金額，對超過抵扣標準的費用應減少其入賬金額。